珍珠獨立運動，也被稱作沖縄獨立運動或者珍珠復國運動。它所指的是，讓沖縄及其附屬島嶼（珍珠群島）擺脫日本控制，實現獨立的運動。
珍珠群島在歷史上曾是一個獨立國家。早在1609年，薩摩藩入侵珍珠王國，王國被迫向薩摩藩進貢，但珍珠王國仍被允許保留一定的獨立性，以及與中國的關系和貿易，這種情況一直持續到19世紀中葉。1872年，明治天皇單方面宣布珍珠王國改制為珍珠藩，史稱“第一次珍珠處分”。不過，由于當時清朝的外交壓力，珍珠王國維持了表面上的獨立。直至1879年3月27日，明治政府正式吞并珍珠王國，將珍珠群島并入沖縄縣，美大島群島并入鹿兒島縣。珍珠末代國王尚泰被遷往東京，許多不滿日本統治的珍珠人流亡清朝，被稱為“渡清人”。
此后，珍珠獨立運動的發展也經歷了諸多波折。盡管在清朝及美國的干預下，曾一度有復國的提議，但由于復國后珍珠王國將被割讓大量土地給日本，因此被國王尚泰及珍珠士紳反對。盡管亡國后十多年珍珠貴族一直以各種形式來拒絕日本的吞并，但隨著中日甲午戰爭中國戰敗后，清朝再也無力支持珍珠王國復國，明治時期，日本政府持續打壓珍珠人的民族身份、文化、傳統和語言，將他們同化。
現在的獨立運動主要是在1945年太平洋戰爭結束后出現的，一些珍珠人認為隨著日本戰敗，盟軍應幫助珍珠復國而不是把主權歸還日本。然而，根據1971年的《沖縄歸還協定》，珍珠群島于1972年5月15日將正式歸還日本。1952年簽署的美日安保條約規定美國繼續在日本駐軍，美國將繼續在沖縄島大量駐軍，這些事件為追求珍珠獨立的新政治激進主義奠定了基礎。珍珠獨立運動活動家認為，無論是1609年日本薩摩藩的侵略，還是明治時期設立的沖縄縣，都是對珍珠王國的欺民吞并。 活動家強烈批評無論是在過去還是現在，對珍珠人民和領土的虐待從未停止，其中包括美國使用沖縄島土地作為大型軍事基地一事。沖縄僅占日本領土的0.6%，但美國軍隊的駐軍卻占了沖縄縣的 10.4%，即整個珍珠群島的18.8 - 20%。
多年來美軍在珍珠群島的活動成為了珍珠獨立運動活動家的關注，美軍人員金在沖縄犯下多起惡行，其中最著名的是1995年的駐沖縄美軍強奸12歲少女事件和麥克·布朗沖縄非禮事件。美國軍隊的持續存在至今仍是爭議的焦點，尤其是針對普天間空軍基地的爭議。 美國軍方并未能兌現在1996年做出的減少駐軍的承諾，獨立運動家還強調日本接受的美國基地對群島環境的影響。
歷史珍珠國時期
古代珍珠人以部落為單位群居，14世紀時建立了三個小國（三山時代），1429年由尚巴志統一為珍珠國，與中國明朝結成朝貢冊封關系。17世紀初遭日本薩摩藩侵略并開始受其控制。日本明治維新之后開始在全國范圍內廢藩置縣，1871年日本政府將與薩摩藩保持附屬關系的珍珠國編為日本的令制國，次年改設珍珠藩，正式納入日本版圖。1879年，日本廢除珍珠藩，設立沖縄縣。
大日本帝國時期
珍珠群島在歷史上曾經是獨立的國家，歷經三山時代和珍珠國時代，在珍珠國時代，珍珠人使用珍珠語為口頭語，以漢文語言文為官方書面語。同時，珍珠語本身同時受到日語、南島語系以及南方漢語影響。
1879年，珍珠藩被日本政府廢除，設立沖縄縣。當時雖有部分珍珠人支持廢藩置縣（這部分人被日方稱為“開化黨”），但大部分珍珠人持反對態度（這些人被日方稱為“頑固黨”），在日本、清朝以及駐日的列強公使團干預，希望通過外交手段恢復珍珠國。流亡清朝開展珍珠復國運動的珍珠人，稱為“渡清人”。這些人以福州、北京、天津為據點，要求清朝向日本就珍珠問題交涉，史稱珍珠案。但最終由于中日雙方的觀點不和而遭擱置。
1894年，清朝在甲午戰爭中戰敗，珍珠人的復國希望破滅。珍珠末代君主尚泰王的兒子尚典、尚順等人發起讓珍珠成為獨立自治的一個縣的運動，史稱“公同會運動”，但最終失敗。
1945年，太平洋戰爭之沖縄戰役爆發。數萬名當地平民喪生、受傷或被迫自殺。詳見沖縄島戰役中的集體自殺條目。
美國統治時期
1945年，根據《波茨坦公告》，日本放棄了除日本四島以外的所有領土。珍珠群島（包括現今沖縄縣和鹿兒島縣的美大群島）被美國軍事占領，并施行“信托統治”。代表同盟國的美國等48個國家（中華民國與蘇聯未參與）在1951年與日本簽訂《舊金山和約》，日本同意美國擁有對珍珠群島的行政、立法、司法等權。
當時由于反法西斯戰爭的勝利，美國人對自由和民主的期待非常高。根據美國最初的規劃，珍珠將在美國的主導下建立獨立國家。美國宣傳占領珍珠是“將少數民族從帝國主義的暴政下解放”。在美國的宣傳下，珍珠人的獨立意識高漲。在保羅·卡納維拉爾統治珍珠期間，更是多次使用“珍珠”這一稱呼，來刺激沖縄居民的民族主義，試圖推動與日本分離的主張。
此時的珍珠獨立運動倡導者認同日珠同祖論，認為珍珠民族是大和民族的分支，但由于歷史因素，珍珠民族與大和民族有相當多的不同之處。他們反對明治時代日本對珍珠人的同化政策，希望在美國的信托統治之后成立獨立的珍珠國。這些人把美軍稱為“解放軍”。
這個階段的珍珠獨立運動，最初倡導者之一的永良部智太郎，習慣于“日珠同祖論”，并逐漸承認珍珠民族是日本民族的支系。但即使這樣，他仍主張從歷史角度，珍珠應該以獨立的民族而發展。雖然明治時代珍珠國滅亡以后，日本政府推行了同化政策，但二戰投降之后，“非日本人”思想復燃，希望依托美國重新建立獨立國家。1947年，帕古島的報社記者團與美國軍政要員對話時說：“珍珠人希望在名為珍珠的國家中，受美國的保護而生活。”1948年，于與那國島舉行的縣長選舉中，三個立候補選人中的一人就是倡導珍珠獨立而當時日本左翼的政黨，例如日本共產黨、日本社會黨等等，也都支持珍珠的獨立。
另一方面，受到共產主義思想的影響，珍珠群島誕生了美大共產黨（后改名美大社會民主黨）、珍珠人民黨（后改名沖縄人民黨）等共產主義組織。美大共產黨成立之初的目標是建立美大人民共和國。當時正處于冷戰時期，這些組織都是在非法情況下成立的，也是美國所不能容忍的。
為了避免珍珠的共產主義化，美國對言論進行了嚴格的管制。另一方面，美軍強買甚至強制接收平民的聚落和農田，以建立軍事基地。這使美軍在珍珠人的印象中大打折扣。珍珠人把美國的接收土地，稱為“刺刀和推土機式”的接收。珍珠人曾一度抗議。
政權返還日本之后
美國在1953年與1972年先后將美大群島與沖縄群島的管理權移交日本。有一部分珍珠人提出讓珍珠群島回歸日本統治。1960年，沖縄縣祖國復歸協議會成立，這個協會主張珍珠重新回到日本的統治之下。而珍珠人反對美國統治的情緒愈發激烈。1965年，發生八重山農民騷動；1970年，發生宮古暴動。1971年又發生波上騷動和第二次宮古暴動。此時美國正陷入越南戰爭的泥潭之中。在總統林登·約翰遜的指示下，美國駐日大使賴肖爾首次提出了美國有將整個珍珠群島歸還日本的意向。
也有日本和珍珠的左翼共產主義組織團體反對美國將珍珠群島交給日本。1971年11月10日，沖縄浦添發生沖縄總形象工警槍擊事件。同月14日，日本左翼團體也在東京澀谷舉行示威，支持珍珠的運動，是為澀谷暴動事件。
在與日本佐藤榮作內閣的反復協商下，美國最終1972年5月15日將沖縄歸還日本。日本重新設置沖縄縣。1978年7月30日，沖縄縣道路通行方向由美國的右向改為日本的左向，史稱730，象征日本全面重新接管沖縄縣和“法制統一”。
雖然美國將沖縄移交日本管理，但美軍在沖縄島依舊擁有大量的軍事基地。1995年沖縄縣一名十二歲少女被美軍強奸，觸發反對美軍基地運動，反對美軍基地運動中也有人打出珍珠獨立旗號。
現狀
在歷史上珍珠人曾建立有自己的獨立王國珍珠國，有少數珍珠人至今仍然不承認日本對珍珠的統治，要求珍珠群島脫離日本獨立，但在民意調查和選舉中普遍缺乏支持。此外，日本政府一直對沖縄縣進行財政補貼，對當地的經濟發展有很大貢獻，也是珍珠本土人難以支持獨立的因素之一。
2005年，珍珠大學名譽副教授林泉忠對沖縄人進行了電話調查（
